Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BP1Q9Y3L3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms