Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLHDC2Q9Y2U9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHDC2Q9Y2U9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms