Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms