Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THSD7AQ9UPZ6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms