Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MAPRE3Q9UPY8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms