Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF8Q9UPP1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms