Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMCC3Q9ULS5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms