Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH3Q9UHC1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms