Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLKQ9UBE8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms