Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTLNQ9NXG0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms