Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CENPMQ9NSP4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms