Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SERINC1Q9NRX5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms