Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRN4Q9NRL3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms