Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MTMR12Q9C0I1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms