Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BARHL1Q9BZE3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms