Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HDAC8Q9BY41 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HDAC8Q9BY41 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms