Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms