Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BBS2Q9BXC9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BBS2Q9BXC9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms