Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLVAPQ9BX97 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLVAPQ9BX97 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms