Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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