Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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