Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms