Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms