Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms