Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms