Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOLD1Q96LR9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOLD1Q96LR9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms