Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms