Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA1Q92743 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms