Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOPBP1Q92547 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms