Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RGP1Q92546 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RGP1Q92546 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RGP1Q92546 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RGP1Q92546 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RGP1Q92546 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms