Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD1Q8NHV4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms