Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PIK3C3Q8NEB9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PIK3C3Q8NEB9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms