Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC50Q8IVM0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms