Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME9Q86XW9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms