Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF550Q7Z398 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms