Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 29.7
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PRPF8Q6P2Q9 CCDC58-206ENST00000497726 438 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -12e-23■■■■■ 29.6
PRPF8Q6P2Q9 CCDC58-201ENST00000291458 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-23■■■■■ 29.6
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PRPF8Q6P2Q9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.193e-30■■■■■ 29.6
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