Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD54Q6NXT1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms