Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TYW3Q6IPR3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms