Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP188Q5SRE5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms