Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q499Y3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q499Y3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q499Y3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q499Y3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q499Y3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q499Y3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q499Y3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms