Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC153Q494R4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms