Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF1Q3BBV0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF1Q3BBV0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms