Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LETM2Q2VYF4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms