Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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