Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC142Q17RM4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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