Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLFQ16534 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLFQ16534 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLFQ16534 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms