Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS72Q15906 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS72Q15906 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms