Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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NPTX1Q15818 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPTX1Q15818 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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