Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF13Q15543 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms