Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RABEP1Q15276 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABEP1Q15276 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABEP1Q15276 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABEP1Q15276 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABEP1Q15276 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABEP1Q15276 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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